Serial Toaru Kagaku no Accelerator atau dikenal A Certain Scientific Accelerator, menceritakan Academy City berdiri di garis depan kemajuan ilmu pengetahuan dan teknologi, yang terkenal karena pengembangan esper: mereka yang mampu menggunakan kemampuan manusia super yang mengubah aturan realitas. Yang paling kuat di antara mereka adalah Level 5, dan yang dikenal sebagai Accelerator berkuasa, bahkan setelah dilemahkan oleh cedera otak yang parah. Di sisinya adalah gadis muda yang dikenal sebagai Last Order, yang meskipun sikapnya dingin, dia pegang erat-erat dan bersumpah untuk melindunginya dengan segala cara. Meskipun Accelerator mungkin sedang dalam masa pemulihan dari cederanya, sisi gelap Academy City tidak pernah berhenti, sehingga dia terpaksa terjebak di tengah konflik baru. Ketika seorang wanita muda misterius mendekati Accelerator untuk mengejar Last Order, esper dengan peringkat tertinggi dihadapkan pada organisasi berbisa yang telah mengakar di Anti-Skill, organisasi penjaga perdamaian Academy City. Dengan pergerakan kekuatan berbahaya yang mengancam Last Order dan saudara perempuannya dalam bahaya, orang yang mengaku sebagai penjahat ini bersiap untuk melangkah ke dalam kegelapan sekali lagi.
