Lokasi kali ini berlatar di laut dekat pulau Hachijo-jima, Tokyo. Para insinyur dari seluruh dunia telah berkumpul untuk operasi skala penuh "Pacific Buoy", sebuah fasilitas lepas pantai untuk menghubungkan kamera keamanan milik pasukan polisi di seluruh dunia. Pengujian terhadap "teknologi baru" tertentu berdasarkan sistem pengenalan wajah sedang berlangsung di sana. Sementara itu, Conan dan Detective Boys mengunjungi Hachijo-jima atas undangan Sonoko dan menerima panggilan telepon dari Subaru Okiya yang memberi tahu mereka bahwa seorang karyawan Europol dibunuh di Jerman oleh Jin Organisasi Hitam. Conan, yang gelisah, menyelinap ke dalam fasilitas dan menemukan bahwa seorang insinyur wanita telah diculik oleh Organisasi Hitam...! Selanjutnya, drive USB yang berisi informasi tertentu miliknya berakhir di tangan organisasi... Bayangan hitam juga merayapi Ai Haibara...
